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        RIP技術(shù)(RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀)

        型    號(hào):
        更新時(shí)間: 2017-08-03

        RIP技術(shù)(RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀)
        RIP技術(shù)(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀),是研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白結(jié)合情況的技術(shù)。分析與目的蛋白結(jié)合的RNA.運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái),然后經(jīng)過(guò)分離純化就可以對(duì)結(jié)合在復(fù)合物上的RNA進(jìn)行分析

        產(chǎn)品介紹:

         

        RIP技術(shù)(RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀)

        RIP技術(shù)(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀)是研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白結(jié)合情況的技術(shù)。分析與目的蛋白結(jié)合的RNA.運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái),然后經(jīng)過(guò)分離純化就可以對(duì)結(jié)合在復(fù)合物上的RNA進(jìn)行分析;即用抗體或表位標(biāo)記物捕獲細(xì)胞核內(nèi)或細(xì)胞質(zhì)中內(nèi)源性的RNA結(jié)合蛋白,防止非特異性的RNA的結(jié)合,免疫沉淀把RNA結(jié)合蛋白及其結(jié)合的RNA一起分離出來(lái),結(jié)合的RNA序列可通過(guò)microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或 高通量測(cè)序(RIP-Seq)方法來(lái)鑒定。是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動(dòng)態(tài)過(guò)程的有力工具,能幫助我們發(fā)現(xiàn)miRNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。

         

        RIP實(shí)驗(yàn)流程
        (一). 細(xì)胞裂解液獲取
        A. 單層細(xì)胞或者貼壁細(xì)胞處理
        1. 冷PBS清洗培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶中的細(xì)胞兩次
        2. 加入冷PBS后用細(xì)胞刮將細(xì)胞刮下來(lái),收集至enpendoff管
        3. 1500rpm,4離心5min,棄上清,收集細(xì)胞
        4. 用與細(xì)胞等體積的RIP裂解液重懸細(xì)胞,吹打均勻后于冰上靜置5min
        5. 每管分裝200ul細(xì)胞裂解液,貯存于-80
        B. 懸浮細(xì)胞處理:先收集細(xì)胞再計(jì)數(shù),然后清洗裂解
        C. 組織樣品處理
        1.冷PBS清洗新鮮切下的組織三次
        2. 加入冷PBS后,用勻漿器或其他細(xì)胞分離設(shè)備使組織分散為單個(gè)細(xì)胞,計(jì)數(shù)
        3. 1500rpm,4離心5min,棄上清,收集細(xì)胞
        4. 用與細(xì)胞等體積的RIP裂解液重懸細(xì)胞,吹打均勻后置于冰上靜置5min
        5. 每管分裝200ul細(xì)胞裂解液,貯存于-80
        (二). 磁珠的準(zhǔn)備
        A. 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
        1、enpendoff管
        2、磁力架
        3、冰盒, RIP Wash Buffer置于冰上
        4、抗體,置于冰上
        5、渦旋震蕩器
        6、槍、槍頭放于超凈臺(tái)照射30min,槍噴DEPC水
        B. 磁珠準(zhǔn)備過(guò)程
        1. 重懸磁珠
        2. 標(biāo)記實(shí)驗(yàn)所需的enpendoff管,樣品包括目的樣品,陰性對(duì)照與陽(yáng)性對(duì)照
        3. 吸取50ul 重懸后的磁珠懸液于每個(gè)enpendoff管
        4. 每管加入500ul RIP Wash Buffer,渦旋震蕩
        5.將enpendoff管置于磁力架上,并左右轉(zhuǎn)動(dòng)15°使磁珠吸附成一條直線,去上清,重復(fù)一次
        6.用100ul的RIP Wash Buffer重懸磁珠,加入約5ug相應(yīng)抗體于每個(gè)樣品中
        7. 室溫孵育30min
        8. 將enpendoff管置于磁力架上,棄上清
        9. 加入500ul RIP Wash Buffer,渦旋震蕩后棄上清,重復(fù)一次
        10. 加入500ul RIP Wash Buffer,渦旋震蕩后置于冰上
        (三). RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀
        A. 準(zhǔn)備工作
        1、冰盒
        2、360°旋轉(zhuǎn)儀
        3、RIP Wash Buffer 、0.5M EDTA 、RNase Inhibitor 置于冰上
        B. RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀實(shí)驗(yàn)過(guò)程
        1.準(zhǔn)備RIP Immunoprecipitation Buffer
        2.將前上步的enpendoff管放磁力架上,去上清,每管加入900ul RIP Immunoprecipitation Buffer
        3. 迅速解凍*步制備的細(xì)胞裂解液,14,000rpm,4離心10min。吸取100ul上清液于上一步的磁珠-抗體復(fù)合物中,使得總體積為1ml
        4. 4孵育3h至過(guò)夜
        5. 短暫離心,將enpendoff管放在磁力架上,棄上清
        6. 加入500ul RIP Wash Buffer,渦旋震蕩后將enpendoff管放在磁力架上,棄上清,重復(fù)清洗6次
        (四). RNA純化
        A. 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
        1.槍、槍頭、enpendoff管紫外照射30min,噴DEPC水以除RNA酶
        2. Salt Solution、Salt Solution、RIP Wash Buffer、Proteinase K、10%SDS、 Precipitate Enhancer 置于冰上
        3.RNase-free的乙醇、(lv)仿、異戊醇
        4.DEPC水置于冰上
        5. 離心機(jī)預(yù)冷
        6. 冰盒
        B. RNA純化過(guò)程
        1.準(zhǔn)備Proteinase K Buffer。每個(gè)樣品需150ul
        2.用150ul Proteinase K Buffer重懸上述磁珠-抗體復(fù)合物
        3. 55孵育30min
        4. 孵育完之后,將enpendoff管置于磁力架上,將上清液吸入一新的enpendoff管中
        5. 于每管上清液中加入250ulRIP Wash Buffer
        6. 于每管加入400ul苯酚:lv仿:異戊醇,渦旋震蕩15s,室溫下14,000rpm離心10min
        7. 小心的吸取350ul上層水相,吸入另一新的enpendoff管
        8. 于每管加入400ullv仿,渦旋震蕩15s,室溫下14,000rpm離心10min
        9. 小心的吸取300ul上層水相,吸入另一新的enpendoff管
        10. 每管加入50ul Salt Solution,15ul Salt Solution,5ul Precipitate Enhancer ,850ul 無(wú)水乙醇(無(wú)RNase),混合,-80保持1h至過(guò)夜
        11. 14,000rpm,4離心30min,小心去上清
        12. 用80%乙醇沖洗一次,14,000rpm,4離心15min,小心去上清,空氣中晾干.
        13. 10-20ul DEPC水溶解,-80保存,送測(cè)序或進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)。

        收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)/服務(wù)周期/提供結(jié)果:
        詳談,我們會(huì)根據(jù)您的方案及需求制定詳細(xì)的服務(wù)協(xié)議。

        【本公司合作項(xiàng)目】
        慢病毒,腺病毒,RNAi類,分子生物實(shí)驗(yàn),病理實(shí)驗(yàn),免疫學(xué)實(shí)驗(yàn),細(xì)胞實(shí)驗(yàn),動(dòng)物實(shí)驗(yàn),蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)等,能夠進(jìn)行藥效學(xué)評(píng)價(jià)、毒理學(xué)評(píng)價(jià)、細(xì)胞藥篩、動(dòng)物建模、病理檢測(cè)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量測(cè)序、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析服務(wù)!

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